新年过后，朱由校颁布了一道的诏书，允许拥有世职的武官改换门庭，放弃军中职务，改授正式的爵位。为了让武官们踊跃报名，他还给出了极大的恩惠，在今年六月之前上书的，除了世袭和原品级同样的爵位外，还恩荫一子入济世大学或钟山大学。
济世大学和钟山大学就是朱由校一手建立的京学，京城的叫济世大学，南京的叫钟山大学，从名字上就可以看出朱由校的偏好。而实际上，钟山大学的规模远远小于济世大学。就连师资，也是先紧着济世大学挑选。如果不是南京地位特殊，江南又人文荟萃，朱由校根本不会在离自己这么远的地方设置大学。
不过，武将们却不知道其中的差别。他们只看到两所大学都是皇帝一手创办的大学，培养的都是皇族的子弟，顿时就动了心。可要想让他们放弃祖祖辈辈掌握的权力，他们却还是有点不太甘心。
紧接着，朱由校的第二道圣旨又来了。
教导营改名讲武堂，成了正式的武学，讲武堂学制四年，设立有步兵、炮兵、骑兵、工兵和辎重等五个学科，同时在天津开设水师分院，全面推行军官养成教育。
为了抬高讲武堂的地位，朱由校特意任命英国公张惟贤为讲武堂祭酒，魏国公徐弘基和黔国公沐睿为司业，原本主持教导营事务的郭子章被封为一等子爵，做了监丞，其他的资深教官也被加封了爵位。到了最后，职务品级虽然要比国子监低，可一水的爵爷却胜过国子监不知道多少倍。
同时，朱由校还对讲武堂的招生范围作了限制，只允许从世爵子弟和军户子弟中录取17岁及17岁以上的男青年。除此之外的人若想从军，就只能老老实实的从大头兵做起。
对于这道圣旨，还是有许多人不在乎，可伴随着圣旨，兵部却下了道公文，却明确规定了今后武官选任的办法，那就是讲武堂毕业者优先，四年后只选任讲武堂毕业生。
这回，很多人开始跳脚了。
兵部武选司的考核有多松，武将们都很清楚。讲武堂前身教导营的招生标准有多残酷，武将们也都听说过。今后武官选任要以讲武堂毕业生优先，他们虽有意见却能接受，可四年后只选任讲武堂毕业生，却让他们暴跳如雷。
也有人从这里看出了玄机，教导营此前招收的都是短期班，全部补充了新军，而讲武堂正式招录却要从现在开始。也就是说，四年内是没有讲武堂毕业生的。
发现了这个漏洞，有心人都开始了算计，原准备过几年再告老的，当即就表示自己老眼昏花，要求让儿子提前考核准备接班。以前闲在家中不愿入京考核的，更是拔腿就跑，生怕去晚了没空位。
这些朱由校都看在眼里，或者说是他有意造成的，能够世袭的军职多是中下层职位，可为了给子孙让路而告老还乡的那些人占据的却都是都指挥使司中的高位。
借此机会，朱由校连下旨意，把各都司的官员调来调去，终于掌握了全部的军权。
掌握军权是后来的事情，此时还是天启元年的正月，朱由校只是颁布了圣旨，圣旨的影响却还有开始反馈回来。此时的朱由校还面临着一次重大的考验，就是召见清太祖皇太极。
只不过，皇太极现在还是个酋长的儿子，此生此世怕是再也不会达到太祖这个高度。
皇太极是正月初八到的京城，却没有第一时间向朱由校求见，没办法，乘坐海船对他来说是一大考验，勉强支撑着到达京城后他就病倒了。
趁此机会，朱由校借助着佟家的消息路线，也探明了皇太极的来意。
皇太极如今遇到了难题，或者说陷入了困境。
作为正白旗的旗主，皇太极拥有25个牛录的力量，这在八旗中十分靠后，仅仅比莽古尔泰的正蓝旗和杜度的镶白旗强一点。
实力差，可皇太极的心却很高，他立功心切去偷袭朱由校，兵败之后损失了大部分的精兵，连最精锐的巴牙喇精兵也留在了辽东。如果不是还维持着25个牛录的纸面数字，他的实力就要排到八旗的最后。以至于回到驻地后，皇太极连续做了好几天噩梦。
可惜，皇太极的噩梦还仅仅是个开始。他偷袭朱由校的行动激怒了新军将士，以至于新军敌后袭扰时，有意无意的总拿他开刀。
在一年多的时间里，皇太极属下的庄子不断的受袭击，生产破坏，奴隶逃亡，前不久还让费扬塔珲葬送了几乎一牛录的骑兵。正白旗如今的实力已经大损，落到了正蓝旗后面，只能和镶白旗为伍。
无奈之下，皇太极主动向**哈赤请缨，来向大明认罪求和。
“认罪，求和。”朱由校的脸色十分古怪，他现在的身份是鸿胪寺官员，奉旨来向皇太极问话。实际上却是好奇心起，想看看皇太极是个什么样的人。
一见皇太极，朱由校就大失所望，不就是个蛮子，虽然身材魁梧，却还是难脱蛮夷习性。不过，朱由校却还是对他抱有戒心，暗暗下了把他留在京城的念头。
皇太极以为面前真的是鸿胪寺的官员，就十分郑重的提出了自己的条件，“对，是认罪，我们愿意去掉可汗的称号，重新请求朝廷的册封。只要朝廷对我们一视同仁，同意开市，我们就息兵罢战，永不反叛。”
朱由校一声嗤笑，“贵使说的都是缓兵之计吧，现在你们的日子不好过，就主动投降服输，借助开市的机会重整军备。等你们缓过劲了，再向我大明动刀动枪的。”
见朱由校说的直白，皇太极大感意外，好半天才笑着摇摇头，“怎么会呢，只要朝廷公平对待我等，我们怎么会再动兵戈呢。”
“是吗？”朱由校冷笑，“朝廷其实一直都带你们不薄，只不过是你们父子贪心不足罢了。也罢，这些事情自然有官员来和你讲。本官奉旨再问你句话，”朱由校直视着皇太极，“年前你们攻击蒙古人，到底是何目的？”
“这，”突如其来的一问，却让皇太极犯了难，好半天才有了回答，“我们和喀尔喀人向来不和，发生争端在所难免。”
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